Nyamuk wolbachia juga dapat digunakan untuk mengendalikan populasi nyamuk pembawa virus dengue. Ketika nyamuk Aedes aegypti jantan ber-wolbachia kawin dengan nyamuk betina yang tidak memiliki wolbachia, telur yang dihasilkan tidak akan menetas. Karena telur itu tidak menetas, populasi nyamuk Aedes aegypti pun menurun.

Sedangkan, nyamuk Aedes aegypti jantan biasa atau ber-wolbachia yang kawin dengan nyamuk betina ber-wolbachia akan menghasilkan telur nyamuk ber-wolbachia pula. Namun, nyamuk ber-wolbachia ini tidak dapat menularkan virus dengue seperti nyamuk Aedes aegypti biasa. ***