Dalam beberapa kasus, hipopituitarisme disebabkan oleh mutasi genetik (diwariskan). Mutasi ini mempengaruhi kemampuan kelenjar pituitari untuk menghasilkan satu atau lebih hormonnya, sering kali dimulai saat lahir atau pada masa kanak-kanak awal.

Tumor atau penyakit hipotalamus, bagian otak yang terletak tepat di atas hipofisis, juga dapat menyebabkan hipopituitarisme. Hipotalamus menghasilkan hormon sendiri yang secara langsung mempengaruhi aktivitas kelenjar pituitari.

Dalam beberapa kasus, penyebab hipopituitarisme tidak diketahui.

(***)